En 1992, Djibouti a adopté une Constitution qui a introduit le multipartisme. Le paysage politique du pays est dominé par le parti du président Ismail Omar Guelleh en fonction depuis 1999. Depuis que l’opposition armée du FRUD est entrée dans le processus de pacification en 2001, le pays cherche cahin-caha à renforcer la construction d’une identité djiboutienne. Les premières élections vraiment multipartites depuis l’indépendance du pays (en 1977) ont eu lieu le 10 janvier 2003. Le 11 janvier 2003, à l’annonce des résultats, l’opposition, qui n’a obtenu aucun siège à l’Assemblée nationale, dénonce une fraude massive. Le 4 septembre 2003, la Fédération Internationale des ligues des droits de l’homme (FIDH) a dénoncé et condamné des expulsions de près de 60 000 travailleurs immigrés, les qualifiant de "suicidaires et brutales". Le 21 octobre 2007, 15 à 20000 personnes, selon les organisateurs, ont manifesté à Ali-Sabieh, dans le sud du pays, pour protester contre l’enquête de la justice française sur la mort du juge français, Bernard Borrel, en 1995 à Djiboui. Les élections législatives de février 2008 ont donné la totalité des sièges du parlement à l’Union pour la majorité présidentielle (UMP, parti présidentiel). L’opposition unie de quatre partis avait dénoncé une fraude électorale en vain. En juin 2008, des incidents armés meurtriers se sont déroulés entre Djibouti et l’Erythrée, dans la zone de Domaira. L’Erythrée est en effet accusée de jouer un rôle déstabilisateur dans la région de la Corne de l’Afrique notamment en Somalie. A l’occasion de l’avènement du nouvel an 2010, revenant sur le conflit frontalier avec l’Erythrée, le président Guelleh a déclaré : "Djibouti ne sera jamais prise en otage par qui que ce soit, ni ne se laissera jamais entraîné dans un conflit qui vise, sciemment, à lester notre développement socio-économique, à hypothéquer l’avenir prometteur de notre pays", fin de citation. Il est à noter que Djibouti a joué un rôle déterminant dans l’accueil et l’organisation de la réunion ayant permis en août 2008, sous les auspices de l’ONU, d’aboutir à la signature officielle de l’accord de paix entre le Gouvernement fédéral somalien et l’Alliance pour la re-libération de la Somalie (ARS).